Etat d'activité de Gordon :

Gordon est placé en stase
Evènements majeurs : 1.2. La Résonance en Chaîne
- La Résonance en Chaîne (Activée par le GMan)
- Le Cartel s'en rend compte
- Nihilanth est vaincu
- Black Mesa est détruit
- Gordon survit
- Gordon est "embauché"
Détails :
Ils vous attendent Gordon, dans la chambre de test. GMan orchestre la Résonance en Chaîne.
Le "GMan" est un personnage très mystérieux de Black Mesa dont les motivations ne semblent liées ni à l'humanité, ni au Cartel. Il déclanche la Résonance en Chaîne dans le Laboratoire des Matériaux Anormaux de Black Mesa en y apportant un échantillon de test bien spécifique. Son choix pour ce matériau dangereux est masqué par un crash du système, pour couper court aux communications entre les scientifiques. La Résonance en Chaîne qui s'ensuit déchire l'espace-temps et créé un portail dimensionnel entre la Terre et Xen. C'est à ce moment que Nihilanth et les siens voient ce passage comme un moyen d'échapper à l'Empire du Cartel. Bien évidemment, les crabes de tête et autres formes de vies de Xen décident également de faire un petit tour sur Terre, juste pour voir. Black Mesa sombre alors dans le chaos le plus total, alors que l'unité de combat en environnement hostile, une unité spéciale du corps des marines des Etats-Unis, est envoyée sur place pour nettoyer la zone, incluant l'élimination de tous les humains pris entre deux feux.
Cette Résonance en Chaîne est tellement énorme de nature que l'Empire du Cartel la remarque, et s'intéresse de plus près à ce qu'il se passe sur Terre.
Pendant ce temps, un homme en combinaison CEH devient alors la source d'interêt principale de GMan. Gordon Freeman, un scientifique récemment assigné au Laboratoire des Matériaux Anormaux montre des compétences exceptionnelles dans le domaine de la survie contre les Xéniens et les marines. Cet interêt atteint son apogée lorsque Gordon se rend sur Xen (Où les Xéniens le considèrent aussi hostile que le Cartel) et vainc Nihilanth. GMan est impressioné.
La suite est simple, Black Mesa est vaporisé par une explosion nucléaire (vu dans l'addon Opposing-Force). Seuls quelques survivants s'en sortent, comme le Dr. Wallace Breen, ancien administrateur du complexe; Barney Calhoun, un garde; le Dr. Isaac Kleiner, scientifique reconnu de Black Mesa; le Dr. Éli Vance et bien sûr sa fille, Alyx Vance. Alyx est d'ailleurs particulièrement surveillée par GMan et semble avoir été sauvée de Black Mesa par ce dernier (ndt: Peut-être pour pouvoir faire du chantage auprès d'Éli Vance. Le Dr. Arne Magnusson d'Half-Life 2: Episode 2 fait également partie des survivants).
Gordon est "embauché"
A la fin de Half-Life 1, GMan est impressioné par le travail accompli par Gordon et lui propose un choix binaire, la mort ou travailler pour lui. Half-Life 2 assume que vous ayez fait ce dernier choix. Après avoir accepté, GMan place Gordon dans un "slow-time-warp" (ndt: il est "mis en pause" dans une autre dimension) en attendant d'avoir besoin de ses services à nouveau.